Sumberdaya alam merupakan potensi penggerak perekonomian utama di Kota Bontang, terutama migas dan sumberdaya perairan laut. Tanpa tata kelola sumberdaya alam yang baik, potensi yang ada dapat menjadi permasalahan bagi pembangunan daerah. Keberadaan industri migas disinyalir menjadi salah satu penyebab permasalahan lingkungan di Kota Bontang. Kualitas lingkungan hidup dikota ini menurun dengan adanya polusi udara dan air. Terjadinya pencemaran juga merugikan potensi sumberdaya lainnya, terutama sumberdaya perikanan laut yang dapat menjadi alternatif utama penggerak ekonomi daerah setelah migas.
Permasalahan lingkungan hidup dan kerusakan sumberdaya alam harus menjadi perhatian, karena dalam jangka panjang akan mempengaruhi bukan hanya perekonomian daerah namun juga hajat hidup masyarakat. Terlebih lagi jika sebagian besar rumahtangga masyarakat tergantung pada sumberdaya alam sebagai mata pencahariannya. Permasalahan lingkungan hidup dan tata kelola sumberdaya alam juga sering menjadi pemicu konflik sosial sehingga sebagai permasalahan pembangunan harus menjadi prioritas utama untuk diselesaikan. Tabel 4.1 memperlihatkan permasalahan pembangunan di Kota Bontang dari bidang